شبیه سازی جنبه های مختلف انتخاب ژنومی و صحت برآوردها در گاوهای هلشتاین

مقایسه روش های مختلف آماری در انتخاب ژنومی گاوهای هلشتاین

Genomic selection combines statistical methods with genomic data to predict genetic values for complex traits.  The accuracy of prediction of genetic values ​​in selected population has a great effect on the success of this selection method. Accuracy of genomic prediction is highly dependent on the statistical model used to estimate marker effects in reference population. Various factors such a...

مقایسه روش های مختلف آماری در انتخاب ژنومی گاوهای هلشتاین

انتخاب ژنومی، ارزش­های ژنتیکی را در صفات پیچیده کمی از طریق ترکیب داده­های ژنومی و فنوتیپی با استفاده از مدل­های آماری پیش­بینی می­کند. صحت پیش­بینی ارزش­های ژنتیکی در جمعیت تحت انتخاب اثر زیادی بر موفقیت این روش انتخاب دارد. مدل آماری که برای برآورد اثرات نشان­گری در جمعیت مرجع از آن استفاده می­شود، از عوامل مؤثر بر صحت پیش­بینی­ها می­باشد. عوامل مختلفی مانند تراکم نشان­گری، جمعیت مرجع و معمار...

شبیه سازی برنامه انتخاب گاوهای هلشتاین ایران

مطالعه حاضر با هدف شبیه سازی برنامه انتخاب گاوهای هلشتاین ایران با در نظر گرفتن چهار مسیر انتخاب (شامل مسیرهای پدر پدران (ss)، پدر مادران (sd)، مادر پدران (ds) و مادر مادران (dd)) و تعیین ترکیب بهینه عوامل موثر بر پیشرفت ژنتیکی و راندمان اقتصادی انجام شد. در مرحله اول روش آزمون نتاج گاوهای نر در شرایط فعلی کشور مورد بررسی و عوامل موثر بر پیشرفت ژنتیکی در هر یک از چهار مسیر انتخاب تعیین گردید. س...

اثرات واریانس QTL بر صحت انتخاب ژنومی

شبیه سازی جمعیت اولیه (تاریخی) و تعیین صحت عدم تعادل پیوستگی در مطالعات شبیه سازی ژنومی

جهت بررسی صحت عدم­تعادل پیوستگی در مطالعات شبیه­سازی ژنومی، جمعیتی در دو حالت عدم­تعادل پیوستگی صفر و یک در نسل اول شبیه سازی شد. از معیارهای اندازه مؤثر جمعیت، میزان عدم­تعادل پیوستگی و واریانس بین نشانگرها جهت تعیین صحت شبیه­سازی استفاده شد. نتایج نشان دهنده همبستگی بالا بین اندازه مؤثر جمعیت مشاهده شده و مورد انتظار بود. همچنین میزان عدم­تعادل پیوستگی مشاهده شده و مورد انتظار بر هم منطبق شدن...

برآورد صحت انتخاب ژنومی در جوامع کوچک ژنتیکی- مطالعه‌ شبیه‌سازی

In the present study two genetically connected small and large populations were simulated and the effect of different sources of information from foreign populations on the accuracy of predicted genomic breeding values of young animals of the small population was investigated. A large population consist of 200000 animals over 15 generations and a small population consist of 5000 animals over 3 ...